La pédagogie par projet est un point fort de l'enseignement. Cela permet aux étudiants d’appliquer leurs connaissances à des objectifs concrets.
Encadrés par des enseignants et personnels des laboratoires, les projets sont de véritables activités d'initiation à la recherche favorisant la démarche scientifique et développant les qualités d'organisation et de communication au sein d’une équipe.
Le cursus compte trois activités de projets :
- les projets d'initiation à la recherche (PIR) de 1re année dont la thématique est libre,
- les travaux expérimentaux (TREX) de 1e et 2e année qui s'organisent au sein des unités de formation de l'Institut avec l'appui de certains départements de l'ONERA,
- les projets d'initiation à la recherche (PIR) de 2e année.